Résident evil révélations 2 se déroule entre le cinquième et le sixième épisode. L'histoire démarre avec Claire Redfield, kidnappée avec Moira Burton, fille de Barry qui fête son arrivée au sein de l'équipe Terra Save, pendant une soirée organisée par l'organisme humanitaire "Terra Save" par des hommes armés qui attaquent les invités. Moira est une grande fan de Claire, ce qui l'a amené à la rejoindre dans le mouvement.
Claire se réveille dans une prison lugubre, sur une île perdue transformée en site expérimental et semble t-il russe. Comme Moira, elle découvre à son poignet un curieux bracelet lumineux, dont la couleur évolue du vert au rouge en accord avec les émotions du porteur, susceptible de muter en cas de peur extrême. Ce bracelet leur permet également de communiquer avec une femme leur révélant être "la sentinelle" qui leur annonce qu'elles doivent rejoindre le Wossek "où la vie commence".
Elles continueront leur route et trouveront une tour radio. Elles s'y précipiteront en passant pas un vieux pont, par lequel Moira risquera de tomber. Claire s'excuse, avant de rentrer, auprès de Moira. Elle sait qu'elle ne sait pas dans quoi elle l'a embarqué et craint la réaction de Barry à son égard "Barry ne me le pardonnera jamais" et Moira répondra de façon crue que c'est pas de sa faute et que Barry "peut aller se faire foutre". Une fois à l'intérieur, Claire tente de faire fonctionner la radio mais sans succès. Elle décide de laisser la jeune femme à l'intérieur tandis qu'elle, va grimper au sommet de la tour pour la réactivé, cette fois ci avec succès. Une fois allumée, Moira va en profiter sans perdre de temps pour passer un s.o.s, même plusieurs mais sans réponses.
Nous retrouvons ensuite les deux femmes arrivant dans un village de pêcheurs, en direction du Wossek, un bar. Claire décide de rentrer prudemment quand un homme tente de la mettre à terre. Après l'avoir contrôlé et pointé son arme dessus, elle découvre qu'il s'agit de Gabriel "Gabe", un partenaire bossant pour Terra Save lui aussi enlevé à la soirée. Derrière se cache Pedro, autre coéquipier. Ils lui annoncent qu'ils s'étaient réveillés tous deux ainsi que Neil, le boss de Claire, et Edward, décédé, au milieu de la forêt. Pour les sauver, Neil a attiré les Affligés (créatures) dans une direction opposée en attendant de les rejoindre et Claire apprend que Gabe a coupé la main de Edward pour prendre le bracelet et ainsi découvrir comment il fonctionne. De même, Claire leur annonce que Gina est morte dans le camp quelques heures auparavant, en s'adressant à Gabe. Tous les quatre examinent les quelques pièces avant que la Sentinelle ne les contacte une fois de plus. Cette fois, elle passe à la vitesse supérieure et annonce qu'ils participent à une expérience visant à les tuer un par un en n'en laissant qu'un. Elle leur apprend qu'ils sont également tous, grâce au bracelet, infectés par un virus, au désarroi de Moira qui n'hésite pas à l'insulter. Elle fera également référence à la mort et la vieillesse et en fera une métaphore pour expliquer le processus de l'expérience. Après quoi, Claire, Gabe et Moira sortent pour examiner un coin du village où Gabe a trouvé un hélicoptère presque en état de marche. Après diagnostic, Gabe s'aperçoit qu'il manque essence et batterie. Claire propose à Gabe de rester pour continuer de regarder l'hélico tandis qu'elle et Moira iront à la recherche des éléments manquants. Claire et Moira sont ensuite accueillies par des cris d'Affligés ce qui les oblige à se dépêcher. Elles fouilleront chaque recoin avant de tomber sur une maison qui abritait une batterie. Plus loin, Pedro, ayant fini d'examiner le bracelet, dégage les chemins bloquées grâce à une foreuse. Il leur débloque un passage, une entrée de maison, cachant un AB-50, (un pistolet mitrailleur) et ses balles. Plus loin se trouve une chaufferie, elle aussi bloqué par un mur de pierre. Pendant que Pedro va détruire ce mur, Claire et Moira le protégeront car ils seront temporairement assaillis par des Affligés et un Iron Head, un dérivé des affligés plus costaud et grand, recouvert de métal et armé d'une géante hache ou d'une géante massue de pierre. Une fois ouverte, les deux filles pénètrent et récupèrent munitions et essence. Tous les trois iront donc rejoindre Gabe pour lui donner le matériel nécessaire pour qu'il puisse essayer de faire fonctionner l'appareil. Mais les retrouvailles seront de courtes durées car la Sentinelle activera les sirènes du bar depuis sa cachette pour attirer les monstres dans les parages. Pour ne pas qu'ils soient encerclés, Claire, Pedro et Moira iront les stopper et faire diversion. Mais ils seront vite dépassés et seront obligés de se réfugier dans le Wossek où ils vont tenter tant bien que mal de survivre. Après plusieurs coups de feu, Pedro manque de se faire tuer et de peur ira au fond de la pièce. Alors que les filles se battent, Pedro panique et suffoque. Claire va vouloir l'aider mais il se transforme tout à coup et l'étrangle. Moira saute alors sur Pedro pour qu'il la libère et le repousse par la même occasion. La Sentinelle leur explique alors que son bracelet, devenu rouge vif, a été activé par la peur qu'il n'a pu contrôlé, l'a infecté et dit par amusement qu'il est éliminé. Pedro Mutant saisi alors sa foreuse et tente de tuer les femmes. Après une courte lutte, trois Affligés détruisent la porte d'entrée. Elles fuient mais sont prises au piège dans la ville fermée de toute issue. Elles se battent alors jusqu'à la venue de Neil qui leur descend une échelle du haut du Wossek. Elles grimpent puis le suivent sur les bords de la falaise avant qu'il ne débloque une porte.
Claire mentionnera l'abandon de Gabe mais Neil lui répondra qu'il est un ex militaire et qu'il saura se débrouiller. Les trois compagnons iront donc sur le seul chemin qui leur est offert et descendront dans les égouts. Dessous, Neil demandera ce qu'était ce monstre et Claire lui apprend que c'était Pedro. Elle en profitera même pour présenter Neil à Moira. Une fois sorti, ils aperçoivent une tour étrange. Claire suppose qu'il sagit de la planque de la Sentinelle et mentionne l'idée d'y aller. Neil propose d'attendre jusqu'à l'aube mais Claire lui fait part de son désaccord en lui expliquant qu'à l'aube ils seront probablement tous morts. Ils se dirigent donc vers la tour où ils seront attaqués par quelques chiens contaminés. Après avoir entendu l'hélicoptère réparé par Gabriel s'écraser à cause de la Sentinelle et rencontré brièvemment Natalia, enlevé en même temps qu'elles, elles découvrent une liste de tous les agents du Terra Save ainsi que Natalia écrit par Neil.
Neil se révélera être un traître et fidèle de l'UFBC. Déchu, depuis les évènements de Terragregia (Résident evil révélations). Claire et Moira le combattront après que la femme qui a tramé tous les événements de l'île "la Sentinelle" lui a injecté l'Uroboros le transformant en une espèce de Tyrant. Une fois vaincu, Claire et Moira feront la rencontre de "la Sentinelle" qui activera le système d'auto-destruction avant de se suicider en promettant que sa mort sera "sa libération".
Ici deux fins possibles : selon avec quel personnage vous tuez Neil, Moira meurt et se retrouve ensevelie sous des décombres alors que l'on voit son bracelet montrait qu'elle est au maximum de sa peur. Claire, elle s'échappera de la tour en sautant dans la mer et se réveillera à l'hôpital pour annoncer à Barry la mort de Moira.
Si elle ne meurt pas, après sa séparation avec Claire, elle sera recueillie par Evgeny Rebic un vieillard avec qui la relation sera très dure autant que la cohabitation. Mais le vieil homme décidera de mourir laissant Moira Burton livrer à elle-même l'appelant à la fin par son prénom et non plus comme d'habitude "Kroshka".
Ce premier duo laisse place dans chaque épisode à Barry Burton, venu six mois plus tard chercher sa fille laissée pour morte sur l'île. Il y rencontre la petite Natalia Korda, une orpheline de Terragregia un brin louche à qui il demande de l'aider dans sa quête. Natalia a notamment la capacité de "sentir" les créatures, enveloppées d'un halo lumineux à travers les murs.
Elle aura de brèves souvenirs qui reviendront sans savoir ce qui s'est vraiment passée pendant les six derniers mois et conduira Barry là où elle a vu Claire et Moira pour la dernière fois. Quand ils arrivèrent à la tour radio, ils entendirent le message radio de Moira, Natalia qui souffrait soudainement d'un mal de tête, annonca que Moira était décédée. En discutant pendant le trajet, Barry apprit que Natalia était présente durant la Panique de Terragrigia, et que c'était à ce moment là qu'elle perdit ses parents et fut sauvée par Neil Fisher. En chemin, ils affronteront Pedro et le tuent définitivement. Ils arriveront à la tour et apercevront un tableau d'Albert Wesker avec une femme blonde. On comprendra qu'Alex Wesker, la Sentinelle et la soeur de Wesker née des expériences d'Umbrella, s'est installée sur une île d'ouvriers russes, auquel elle a promis du travail pour mieux les exploiter et utiliser leurs corps pour ses expériences. Expériences autour du virus T-Phobos, mais surtout l'immortalité, qu'elle compte atteindre en se réincarnant dans le corps de Natalia, qui a réussi les tests pour dominer sa peur, après s'être suicidée.
Croyant que son transfert de conscience vers Natalia a échoué, elle enragera et l'attaquera pour la tuer. Barry la sauvera et ils s'enfuiront. Plus tard, Alex jette Barry du haut d'une falaise et étrangle Natalia mais panique en voyant quelque chose dans son regard. Natalia retrouve Barry et ils partent à la recherche d'Alex pour venger la mort de Moira, ils la retrouvent dans un laboratoire caché. Elle s'injecte le virus Uroboros et s'engage dans une confrontation sanglante contre Barry.
Moira qui cherchait un moyen de partir de l'île jusqu'à là, retrouve enfin son père et Natalia. Ils arrivent à échapper à Alex grâce à Claire Redfield revenue pour aider Barry. La Sentinelle vit son trépas par une roquette lancée par la sœur de Chris Redfield la tuant sur le coup.
Deux ans plus tard, la vie de Moira reprit son cours avec une relation avec son père beaucoup plus stable et une nouvelle sœur qui n'était autre que Natalia qui a été adoptée par Barry et Kathy. On aperçoit dans la chambre de Natalia des articles sur le bio-terrorisme et un livre de Kafka, écrivain qu'aimait beaucoup Alex. Natalia cite un passage du livre en souriant, ce qui laisse à penser que la conscience pervertie d'Alex Wesker est bien présente dans son cerveau mais elle n'a pas été transféré mais copié.
Si Moira est morte plus tôt, la mauvaise fin s'enclenche au moment du combat final et Natalia tombe inconsciente puis se réveille, les yeux rouges vifs puis ampute le bras d'Alex et enfin lui arrache le coeur. Effrayé et étonné, Barry demande des explications sur ce qu'a fait Natalia, mais celle-ci commence à agir de façon très étrange et se retourne après que Barry l'appelle par son nom agissant de façon hautaine avec un ton arrogant jusqu'à lui demandait de l'appeler Alex Wesker révélant qu'Alex avait en réalité copié son esprit dans le corps Natalia qui avait vue sa conscience disparaître complètement. Natalia/Alex partit des lieux laissant Barry frustré et perdu en voyant ce qui s'était passé.